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清华团队Cell子刊发表单细胞RNA测序研究
  来源:百世嘉    标签:清华团队Cell子刊发表单细胞RNA测序研究      2016-07-04 09:21:11
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下一代测序技术(Next Generation Sequencing)可大大促进我们对生理发育及疾病过程的理解。不过NGS的研究对象是细胞群体。这样的测序技术通常会忽视细胞之间看似微小但极其重要的异质性。正因如此,单细胞测序(Single Cell Sequencing)技术受到了越来越多的关注。


清华大学研究团队通过单细胞RNA测序系统重建了调控生长板(Growth Plate)发育的分子级联。这项研究发表在5月日的Cell Reports杂志上。文章通讯作者为清华大学生命科学学院的吴琼(Qiong Wu)研究员。



生长板是骨骼延长和再生的关键结构。虽然人们已经鉴定了生长板发育的一些关键调控子,但对这一过程还缺乏系统性了解。研究人员对生长板的217个细胞进行单细胞RNA测序,确定了这些细胞的基因表达谱。同时,他们还开发了一个重建生长板生理发育的信息学工具Sinova,并能达到了很高的时空分辨率。研究人员用该工具鉴定了指导生长板成熟的有效转录因子组合,并通过体外筛选进行了验证。研究指出,这个生物信息学工具也可以用于其它的发育过程。



参考文献:Systematic Reconstruction of Molecular Cascades Regulating GP Development Using Single-Cell RNA-Seq

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